一、员工擅自离职违约金如何支付？
1、劳动合同法规定了两种情形可以约定违约金：
（1）接受了用人单位的专项培训，并且签订了服务期协议，劳动者违反服务期协议的，需要支付违约金；
（2）劳动者签订了竞业禁止协议，违反了协议内容，需要支付违约金；
（3）除了以上两种情形，不得约定违约金；
2、自动离职，因为没有交接工作，给用人单位造成损失的，用人单位可以追偿。
二、关于员工擅自离职违约金的法律依据是什么？
1、《劳动合同法》第二十二条：用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与该劳动者订立协议，约定服务期。
劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用。用人单位要求劳动者支付的违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。
用人单位与劳动者约定服务期的，不影响按照正常的工资调整机制提高劳动者在服务期期间的劳动报酬。
2、《劳动合同法》第二十三条：用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项。
对负有保密义务的劳动者，用人单位可以在劳动合同或者保密协议中与劳动者约定竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。劳动者违反竞业限制约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。
3、《劳动合同法》第二十五条：除本法第二十二条 和第二十三条 规定的情形外，用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金。
综上所述，在《劳动法》中，对员工擅自离职违约金的规定主要体现在两方面，在约定服务期内离职的和违反竞业条款的，员工需要按照合同约定支付违约金。除此之外，用人单位不得和员工约定违约金。如员工擅自离职给单位带来损失，单位可以向其追偿，具体赔偿金额要以实际损失为准。