一、外商投资公司分公司注销程序
1、董事会决议通过
2、投资方（股东）批准
3、商务部门批准
4、成立清算组，清算资产，公告，出具《清算报告》
5、税务（国税、地税）登记证注销
6、海关、财政、统计部门注销核准
7、外汇登记证注销（外币、人民币购汇后汇出，外币、人民币账户销户）
8、工商（营业执照）注销
9、组织机构代码证注销
10、劳动登记证注销
二、外商投资企业注销清算
1、清算的期限
企业清算开始之日为企业经营期限届满之日，或者企业审批机关批准企业解散之日，或者人民法院判决或者仲裁机构裁决终止企业合同之日。企业清算期限自清算开始之日起至向企业审批机关提交清算报告之日止，不得超过180天。因特殊情况需要延长清算期限的，由清算委员会在清算期限届满前15天内，向企业原审批机关申请。延长的期限不得超过90天。
2、清算委员会
自清算开始之日起15天内，企业董事会应组织成立至少由3人组成的清算委员会，其成员一般在董事中选任，并可聘请在中国注册的会计师、律师担任。清算委员会的主要职权是：
（1）清理企业财产，编制资产负债表和财产清单，制定清算方案；
（2）公告未知债权人并书面通知已知债权人；
（3）处理与清算有关的企业未了结的义务；
（4）提出财产评估作价和计算依据；
（5）清缴所欠税款；
（6）追回股东应缴而未缴的款项；
（7）清理债权、债务；
（8）处理企业清偿债务后的剩余财产。
（9）代表企业应诉和起诉。
3、清算通知与公告
企业应当自清算开始之日起7天内书面通知企业审批机关、企业主管部门、海关、外汇管理机关、工商登记机关、税务机关和企业开户银行等有关单位，企业有国有资产的，还须通知国有资产管理部门。此外；自清算委员会成立之日起10天内，书面通知已知的债权人申报债权，并应当自成立之日起60天内，至少两次在一种全国性报纸，一种当地省或市级报纸上刊登公告。第一次公告应当自清算委员会成立之日起10天内刊登。
三、办理注销工商登记提交的资料
1、申请报告（2份）
2、工商局提供的《外商投资企业（分支、办事机构）注销登记申请书》（2份原件）
3、董事会关于企业注销的决议（2份原件、1份复印件）
4、《批准证书》正本和副本2（原件）
5、企业在市级报刊上三次公告的证明资料（2份原件、1份复印件）
6、税务机关出具的完税证明）（1份原件、1份复印件）
7、海关出具的守税证明（1份原件、1份复印件）
8、经董事会确认的清算程序、原则和清算委员会人选（2份原件、1份复印件）
9、经董事会确认的清理债权债务完结的报告或清算组织负责清算债权债务的文件（1份原件、1份复印件）
10、企业法人营业执照正、副本（1份原件、1份复印件）
11、工商局企业信息卡（LC卡）
12、企业公章
13、代理（办理）企业登记信息表
14、其他工商局要求提交的材料